| 2015 |
|
Doppelstrangbruch-Induktion und DNA-Schadensantwort nach 12C-Ionen- und Photonenstrahlung in U87 Glioblastomzellen |
|
|
Ramon Lopez Perez |
|
|
Dissertation
|
|
Aufbau und Charakterisierung eines Fluoreszenzmikroskops mit astigmatischer Verzeichnung |
|
|
Dominik Waibel |
|
|
Bachelorarbeit
|
| 2014 |
|
Lokalisationsmikroskopische Untersuchungen zu
strahleninduzierten DNA-Doppelstrangbrüchen in
HeLa-Zellkernen und Analyse von Rezeptorclustern
bei Glioblastomzellen |
|
|
Jan Philipp Eberle |
|
|
Bachelorarbeit
|
|
Localization microscopy (SPDM) facilitates high precision control of lithographically produced nanostructures. |
|
|
A.L. Grab, M. Hagmann, R. Dahint, C. Cremer |
|
|
Micron 68 (2015) 1-7
|
|
Far-field Light Microscopy |
|
|
Christoph Cremer |
|
|
eLS
|
|
Single molecule localization microscopy of the distribution of chromatin using Hoechst and DAPI fluorescent probes |
|
|
Aleksander T Szczurek, Kirti Prakash, Hyun-Keun Lee, Dominika J Żurek-Biesiada, Gerrit Best, Martin Hagmann, Jurek W Dobrucki, Christoph Cremer and Udo Birk |
|
|
Nucleus 5 (2014) 331
|
|
Kombination von Strukturierter Beleuchtung und Lokalisationsmikroskopie in einem neuen Setup mit Anwendungen an retinale Strukturen |
|
|
Sabrina Roßberger |
|
|
Dissertation
|
|
Entwicklung eines hochauflösenden Ophthalmoskops mit strukturierter Beleuchtung und Beiträge zur Verbesserung der zugrundeliegenden Mikroskopiemethode |
|
|
Gerrit Best |
|
|
Dissertation
|
|
Spatial distribution and structural arrangement of a murine cytomegalovirus glycoprotein detected by SPDM localization microscopy |
|
|
P. Müller,N. A. Lemmermann, R. Kaufmann, M. Gunkel,D. Paech, G. Hildenbrand,R. Holtappels, C. Cremer, M. Hausmann |
|
|
Histochem Cell Biol
|
|
Application perspectives of localization microscopy in virology |
|
|
C. Cremer, R. Kaufmann, M. Gunkel, F. Polanski, P. Müller, R. Dierkes, S. Degenhard, C. Wege, M. Hausmann, U. Birk |
|
|
Histochem Cell Biol
|
|
Recollections of a scientific journey published in human genetics: from chromosome territories to interphase cytogenetics and comparative genome hybridization |
|
|
T.Cremer, C. Cremer, P. Lichter |
|
|
Hum Genet
|
|
Quantitative analysis of individual hepatocyte growth factor receptor clusters in influenza A virus infected human epithelial cells using localization microscopy |
|
|
Qiaoyun Wang, Rüdiger Dierkes, Rainer Kaufmann, Christoph Cremer |
|
|
Biochimica et Biophysica Acta (2014)
|
| 2013 |
|
Combination of structured illumination and single molecule localization microscopy in one setup |
|
|
S. Rossberger, G. Best, D. Baddeley, R. Heintzmann, U. Birk, S. Dithmar, C. Cremer |
|
|
J. Opt. 15
|
|
The Combo Microscope: Characterisation and Practical Application |
|
|
Maximilian Hartmann |
|
|
Bachelorarbeit
|
|
Super-Resolution Micrroscopy: Interference and Pattern Techniques |
|
|
Gerrit Best, Roman Amberger, Christoph Cremer |
|
|
Fluorescence Microscopy, From principles to Biological Applications
|
|
High-resolution imaging of autofluorescent particles within drusen using structured illumination microscopy |
|
|
Sabrina Rossberger, Thomas Ach, Gerrit Best, Christoph Cremer, Rainer Heintzmann, Stefan Dithmar |
|
|
Br J Opthalmol
|
|
|
Rossberger et al.
|
|
Resolution enhancement techniques in microscopy |
|
|
Christoph Cremer and Barry R. Masters |
|
|
Eur. Phys. J. H
|
|
|
Paper
|
| 2012 |
|
Charakterisierung der Expansionsregion beim Fragilen-X-Syndrom |
|
|
Christian Mauch |
|
|
Bachelorarbeit
|
|
Localization Microscopy (SPDM) Reveals Clustered
Formations of P-Glycoprotein in a Human Blood-Brain Barrier Model |
|
|
Olga Huber, Alexander Brunner,Patrick Maier, Rainer Kaufmann, Pierre-Olivier Couraud, Christoph Cremer, Gert Fricker |
|
|
PLoS ONE
|
|
|
2012 PLosOne Huber (1.2 MB)
|
|
The actin family member Arp6 and the histone variant H2A.Z are required for spatial positioning of chromatin in chicken cell nuclei |
|
|
Eri Ohfuchi Maruyama, Tetsuya Hori, Hideyuki Tanabe, Hiroshi Kitamura, Ryo Matsuda, Shigenobu Tone, Pavel Hozak, Felix A. Habermann, Johann von Hase, Christoph Cremer, Tatsuo Fukagawa, Masahiko Harata |
|
|
Journal of Cell Science
|
|
Optics Far Beyond the Diffraction Limit |
|
|
Christoph Cremer |
|
|
Springer Handbook of Lasers and Optics
|
|
Quantitative Analyse strahlungsbedingter Chromatinveränderungen mit Hilfe neuer Methoden der supraauflösenden Lichtmikroskopie |
|
|
Sebastian Zeis |
|
|
Bachelorarbeit
|
|
Autofluorescence imaging of human RPE cell granules using structured illumination microscopy |
|
|
Thomas Ach, Gerrit Best, Sabrina Rossberger, Rainer Heintzmann, Christoph Cremer, Stefan Dithmar |
|
|
British Journal of Opthalmology 96 (2012)
|
|
Visualization and Quantitative Analysis of Reconstituted
Tight Junctions Using Localization Microscopy |
|
|
Rainer Kaufmann, Jörg Piontek, Frederik Grüll, Manfred Kirchgessner, Jan Rossa, Hartwig Wolburg, Ingolf E. Blasig, Christoph Cremer |
|
|
PLoS ONE 7(2) (2012) e31128
|
|
|
Kaufmann et al. (802.6 kB)
|
|
Superresolution imaging of transcription units on newt lampbrushes chromosomes |
|
|
Rainer Kaufmann, Christoph Cremer, Joseph G. Gall |
|
|
Chromosome Research 20: 1009-1015
|
|
|
Kaufmann et al.
|
| 2011 |
|
Entwicklung quantitativer Analysemethoden in der Lokalisationsmikroskopie |
|
|
Rainer Kaufmann |
|
|
Dissertation
|
|
Driftkorrektur und Fluoreszenzoptimierung zur Lokalisationsmikroskopie biologischer Nanostrukturen |
|
|
Daniel Paech |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Zellpräparate auf Glasfasern für die axialtomographische
und konfokalmikroskopische Fluoreszenzmikroskopie und
die Rasterelektronenmikroskopie |
|
|
Maren Hilgert |
|
|
Bachelorarbeit
|
|
Improvement of a setup for 5 colours
SW-TIRF-Microscopy |
|
|
Frederik Görlitz |
|
|
Bachelorarbeit
|
|
Superresolution imaging of biological nanostructures by spectral
precision distance microscopy |
|
|
Christoph Cremer, Rainer Kaufmann, Manuel Gunkel, Sebastian Pres, Yanina Weiland, Patrick Müller, Thomas Ruckelshausen, Paul Lemmer, Fania Geiger, Sven Degenhard, Christina Wege, Niels A. W. Lemmermann, R. Holtappels, H. Strickfaden, M. Hausmann |
|
|
Biotech Journal 6 (2011) 1037
|
|
Micro axial tomography: A miniaturized, versatile stage device to overcome
resolution anisotropy in fluorescence light microscopy |
|
|
Florian Staier, Heinz Eipel, Petr Matula, Alexei V. Evsikov, Michal Kozubek, Christoph Cremer, and Michael Hausmann |
|
|
REVIEW OF SCIENTIFIC INSTRUMENTS
|
|
Lichtoptische Nanoskopie von Biostrukturen mit fokussierter, strukturierter und homogener Beleuchtung |
|
|
Thomas Ruckelshausen |
|
|
Dissertation
|
|
Lokalisationsmikroskopie mit mehreren Farben und ihre Anwendung in biologischen Präparaten |
|
|
Manuel Gunkel |
|
|
Dissertation
|
|
Functional Nuclear Organization of Transcription and DNA Replication, A Topographical Marriage between Chromatin Domains and the Interchromatin Compartment |
|
|
Y. MARKAKI, M. GUNKEL, L. SCHERMELLEH, S. BEICHMANIS, J. NEUMANN, M. HEIDEMANN, H. LEONHARDT, D. EICK, C. CREMER, AND T. CREMER |
|
|
Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology
|
|
|
Markaki CSHL (3.4 MB)
|
|
4D Super-Resolution Microscopy with Conventional Fluorophores andSingle Wavelength Excitation in Optically Thick Cells and Tissues |
|
|
David Baddeley, David Crossman, Sabrina Rossberger, Juliette E. Cheyne, Johanna M. Montgomery, Isuru D. Jayasinghe, Christoph Cremer, Mark B. Cannell, Christian Soeller |
|
|
PLoS ONE
|
|
|
4D Super-Resolution Microscopy (1.3 MB)
|
|
Structured illumination microscopy of autofluorescent aggregations in human tissue |
|
|
Gerrit Best, Roman Amberger, David Baddeley, Thomas Ach, Stefan Dithmar, Rainer Heintzmann, Christoph Cremer |
|
|
Micron
|
|
Imaging label-free intracellular structures by localisation microscopy |
|
|
Rainer Kaufmann, Patrick Müller, Michael Hausmann, Christoph Cremer |
|
|
Micron
|
|
Using localization microscopy for statistical analysis of membrane proteins in virus-infected cells |
|
|
Qiaoyun Wang |
|
|
Masterarbeit
|
|
Analysis of Her2/neu membrane protein clusters in different types of breast cancer cells using localization microscopy |
|
|
R. KAUFMANN, P. MÜLLER, G. HILDENBRAND, M. HAUSMANN & C. CREMER |
|
|
Journal of Microscopy
|
|
Combining FISH with localisation microscopy:
Super-resolution imaging of nuclear genome nanostructures |
|
|
Yanina Weiland, Paul Lemmer, Christoph Cremer |
|
|
Chromosome Research
|
|
Lichtmikroskopie unterhalb
des Abbe-Limits |
|
|
Christoph Cremer |
|
|
Physik in unserer Zeit
|
| 2010 |
|
Soft x-ray microscopy of biologic cells |
|
|
Karsten Pufahl |
|
|
Bachelorarbeit
|
|
Aufbau und Kalibrierung eines Zweifarbenlokalisationsmikroskops |
|
|
Sebastian Pres |
|
|
Bachelorarbeit
|
|
Einsatz eines Flüssigkristalldisplays zur Auflösungsverbesserung mittels Strukturierter Beleuchtung |
|
|
Wladimir Schaufler |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Epigenetic regulation of promiscuous gene expression
in thymic medullary epithelial cells |
|
|
Lars-Oliver Tykocinski, Anna Sinemus, Esmail Rezavandy, Yanina Weiland, David Baddeley, Christoph Cremer, Stephan Sonntag, Klaus Willecke, Jens Derbinski, and Bruno Kyewski |
|
|
PNAS
|
|
Hochauflösende Fluoreszenzmikroskopie des retinalen
Pigmentepithels mittels strukturierter Beleuchtung |
|
|
T. Ach, G. Best, M. Ruppenstein, R. Amberger, C. Cremer, S. Dithmar |
|
|
Opthalmologe
|
|
Distance between homologous chromosomes results
from chromosome positioning constraints |
|
|
Claire Heride, Michelle Ricoul, Kien Kiêu, Johann von Hase, Vincent Guillemot, Christoph Cremer, Karine Dubrana and Laure Sabatier |
|
|
Journal of Cell Science
|
|
Second Harmonic Generation Mikroskopie in biomedizinischen Anwendungen |
|
|
Sebastian Schürmann |
|
|
Dissertation
|
|
Measuring and imaging diffusion with multiple scan speed image correlation spectroscopy, |
|
|
Nadine Gröner, Jérémie Capoulade, Christoph Cremer, and Malte Wachsmuth |
|
|
Optics Express
|
|
|
Article
|
|
Lokalisationsmikroskopische Untersuchungen zur Nanostruktur des Zellkerns |
|
|
Sven Beichmanis |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Modelling of Interphase Chromosomes: From Genome Function to Spatial Organization |
|
|
Manfred Bohn |
|
|
Dissertation
|
|
Localization Microscopy Reveals Expression-Dependent Parameters of Chromatin Nanostructure |
|
|
Manfred Bohn, Philipp Diesinger, Rainer Kaufmann, Yanina Weiland, Patrick Müller, Manuel Gunkel, Alexa von Ketteler, Paul Lemmer, Michael Hausmann, Dieter W. Heermann, and Christoph Cremer |
|
|
Biophysical Journal
|
|
|
Bohn
|
|
Correction for specimen movement and rotation errors for in-vivo Optical Projection Tomography |
|
|
Udo Jochen Birk, Matthias Rieckher, Nikos Konstantinides, Alex Darrell, Ana Sarasa-Renedo,Heiko Meyer,Nektarios Tavernarakis, Jorge Ripoll |
|
|
Biomedical Optic Express
|
|
Elektrodenstimulierte Zellaktivität
in Interaktion mit
biokompatiblen Chipoberflächen
|
|
|
Kristian Rink |
|
|
Bachelorarbeit
|
|
Light Microscopic Precise Measurements of Genome Structure during Tumorigenesis in Transgenic Mice |
|
|
Wei Jiang |
|
|
Dissertation
|
|
Vielfarben Lokalisationsmikroskopie mit einem einzelnen Anregungs-Laser unter Verwendung Infraroter Fluorophore |
|
|
Sabrina Rossberger |
|
|
Diplomarbeit
pdf (7.5 MB)
|
|
Implementation of new approaches for measuring protein dynamics by multifocal fluorescence laser microscopy |
|
|
Michael Baum |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Membrane Reconstruction by Spectral Precision Distance Microscopy (SPDM) |
|
|
Yiming Li |
|
|
Masterarbeit
|
|
Optical single-channel resolution imaging
of the ryanodine receptor distribution
in rat cardiac myocytes |
|
|
David Baddeley, Isuru D. Jayasinghe, Leo Lam, Sabrina Rossberger, Mark B. Cannell, and Christian Soeller |
|
|
PNAS, 106, 22275–22280
|
|
Three-dimensional organization of promyelocytic
leukemia nuclear bodies |
|
|
Marion Lang, Thibaud Jegou, Inn Chung, Karsten Richter, Sandra Münch, Anikó Udvarhely, Christoph Cremer, Peter Hemmerich, Johann Engelhardt,Stefan W. Hell and Karsten Rippe |
|
|
Journal of Cell Science, 123 (3), p 392
|
|
Measurement of replication structures at the
nanometer scale using super-resolution light
microscopy |
|
|
D. Baddeley, V. O. Chagin, L. Schermelleh, S. Martin, A. Pombo, P. M. Carlton, A. Gahl, P. Domaing, U. Birk, H. Leonhardt, C. Cremer and M. C. Cardoso |
|
|
Nucleic Acids Research, 2009, 1–11
|
|
Model based precision structural measurements on barely resolved objects |
|
|
D. BADDELEY, Y. WEILAND, C. BATRAM, U. BIRK & C. CREMER |
|
|
Journal of Microscopy, Volume 237, p 70 -78
|
|
|
link to the article
|
| 2009 |
|
Quantitative analysis of Plasmodium sporozoites structure and motility |
|
|
Mikhail Kduryashev |
|
|
Dissertation
|
|
Entwicklung, Bau und Test einer UHV Röntgenstreukammer für die digitale In-Line Holographie |
|
|
Florian Staier |
|
|
Dissertation
|
|
Lichtmikroskopische Untersuchungenkonventionell markierter Präparate weit unterhalb der Beugungsgrenze |
|
|
Paul Lemmer |
|
|
Dissertation
|
|
Entwicklung eines In-Vivo Systems für die Durchführung von In-Vivo Lokalisationsmessungen |
|
|
Alexa Gräfin von Bassewitz |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Weiterentwicklung eines Aufbaus zur multispektralen
hochauflösenden Fluoreszenzmikroskopie mit strukturierter Beleuchtung |
|
|
Gerrit Best |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Genome Folding at the 30 nm Scale |
|
|
Philipp M. Diesinger |
|
|
Dissertation
|
|
Dual color localization microscopy of cellular nanostructures |
|
|
Manuel Gunkel, Fabian Erdel, Karsten Rippe, Paul Lemmer, Rainer Kaufmann, Christoph Hörmann,Roman Amberger and Christoph Cremer |
|
|
Biotechnology Journal, 2009, 4, p. 927
|
|
|
Dual Color Localizaiton - Manuel Gunkel
|
|
Detection of Glutamate In Vivo in the Human Brain using 2D Zero-Quantum Coherence 1H NMRSpectroscopy at 3 Tesla |
|
|
Sarah Rebecca Snyder |
|
|
Dissertation
|
|
Light-Induced Dark States of Organic Fluochromes Enable 30 nm Resolution Imaging in Standard Media |
|
|
David Baddeley, Isuru D. Jayasinghe, Christoph Cremer, Mark B. Cannell and Christian Soeller |
|
|
Biophysical Journal: Biophysical Letters
|
|
|
URL
|
| 2008 |
|
Synthese fluoreszierender Aminoanthrachinon-Farbstoffe und deren Anwendung für das zelluläre Imaging |
|
|
Zuhal Kaya |
|
|
Dissertation
|
|
Hochauflösende multispektrale Fluoreszenzmikroskopie mit lateralen stehenden Wellen |
|
|
Roman Amberger |
|
|
Dissertation
|
|
Entwicklung eines SMI-Mikroskops zur Präzisions-Strukturanalyse in vitalen biologischen Systemen |
|
|
Jürgen Reymann |
|
|
Dissertation
|
|
Grundlegende Charakterisierungsschritte zur Weiterentwicklung einer neuartigen Nanoskopiemethode |
|
|
Christoph Hörmann |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Lokalisationsmikroskopie an biologischen Proben |
|
|
Rainer Kaufmann |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Fluoreszenzmikroskopie mit strukturierter Beleuchtung durch ein Beugungsgitter |
|
|
Alexander Urich |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Light Optical Particle Localization in Clusters |
|
|
Reza Shaingafar |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Fluorescence Microscopy Used for Visualization of Network Activity in Hippocampal Slices of Mouse and Rat |
|
|
Alexandra von Kameke |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Rasterkraftmikroskopische Untersuchungen der Morphologie/Topologie von ClpB/Hsp104 Chaperon-Substraten |
|
|
Barbara Macholt |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Anomalous diffusion of Membrane Proteins |
|
|
Nina Malchus |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Experimental Stochastics in High-Resolution Fluorescence Microscopy |
|
|
Claas von Middendorf |
|
|
Dissertation
|
|
Fast Two-Photon Excited Fluorescence Imaging for the Human Retina |
|
|
Olivier La Schiazza |
|
|
Dissertation
|
|
Development and design ofa spatially and temporally resolved fluorescence fluctuation microscope for the analysis of molecular mobilities and interactions |
|
|
Gerrit Lambertus Heuvelmann |
|
|
Dissertation
|
|
High precision size measurement of centromere 8 and the 8q24/c-myc gene region in metaphase and interphase human fibroblasts indicate differential condensation |
|
|
C. Batram, D. Baddeley, G. Kreth, C. Cremer |
|
|
Journal of Structural Biology, Vol 164, p 293 -303
|
|
|
link to the article
|
|
Nanosizing by spatially Modulated Illumination (SMI) Microscopy and Applications to the Nucleus |
|
|
Udo J. Birk, David Baddeley, and Christoph Cremer |
|
|
The Nucleus: Volume 2, ISBN 978-1-60327-460-9, Chapter 21 p. 389
|
|
SPDM: light microscopy with single-molecule resolution at the nanoscale |
|
|
P. Lemmer, M. Gunkel, D. Baddeley, R. Kaufmann, A. Urich, Y. Weiland, J. Reymann, P. Müller, M. Hausmann, C. Cremer |
|
|
Applied Physics B 93 (2008) 1
|
|
|
direct link
|
|
Precision Measurements with SMI and 4Pi Microscopy |
|
|
David Baddeley |
|
|
Dissertation
|
| 2007 |
|
Mikro-Axial-Tomographie: Optimierung für die hochauflösende 3D-Rekonstruktion von zellulären Strukturen |
|
|
Bianca Reinhard |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Entwicklung eines Zweiphotononenaufbaus zur Aktivierung und Lokalisation einzelner Moleküle |
|
|
Manuel Gunkel |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Optimierung eines SMI-Mikroskops für hochpräzise Größen und Lokalisationsbestimmungen an in vivo Systemen |
|
|
Paul Lemmer |
|
|
Diplomarbeit
|
|
VERGLEICHENDE MIKROSKOPIEMETHODEN AN FLUORESZIERENDEN KERNPORENKOMPLEXEN |
|
|
Kathrin Maecken |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Veränderung der Stärke der aromatischen Wechselwirkungen von Tryptophan zur Untersuchung der Auswirkungen auf dasw kooperative Strukturschalterverhalten eines Peptids von HIV 1 |
|
|
Simon Schweizer |
|
|
Diplomarbeit
|
|
CryoSTED microscopy: A new spectroscopic approach for improving the resolution of STED microscopy using low temperature |
|
|
Arnold Giske |
|
|
Dissertation
|
|
THE 3D SPATIAL ORGANIZATION OF CANCER-PRONE GENES AND INDUCTION PROBABILITIES OF GENOME INSTABILITIES |
|
|
Senthil Kumar Pazahanisamy |
|
|
Dissertation
|
|
Hochpräzisionsgrößenmessung und Bestimmung der Topologie
subchromosomaler Domänen nach molekularer Markierung unter Berücksichtigung des Einflusses der Zellfixierung |
|
|
Claudia Batram |
|
|
Dissertation
|
|
Mikro-Axial-Tomographie: Optimierung für die hochauflösende 3D-Rekonstruktion von zellulären Strukturen |
|
|
Bianca Reinhard |
|
|
Diplomarbeit Bianca Reinhard (10.3 MB)
|
| 2006 |
|
Specimen preparation for Micro Axial Tomography |
|
|
Wei Jiang |
|
|
Masterarbeit
|
|
Fluoreszenz-in Situ-Hybridisierung des prostatakrebsspezifischen Gens AMACR
Untersuchungen zu den präparativen Einflüssen auf die Zellkernmorphologie und -architektur |
|
|
Florence Laure Djikimi Tchetgna |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Dynamic Simluation of active/inactive Chromatin Domains |
|
|
Jens Odenheimer |
|
|
Dissertation
|
|
Hochpräzisionsmikroskopie mit räumlich strukturierter Beleuchtung und Zweiphotonenanregung |
|
|
Hans Mathée |
|
|
Dissertation
|
|
Quantifzierung der dreidimensionalen Mikroarchitektur von Genomelementen nach spezifischer Fluoreszenzmarkierung
in fixierten und vitalen Zellen |
|
|
Stefan Stein |
|
|
Dissertation
|
|
Präzisionsgrößen- und Distanzmessungen an multispektral fluoreszierenden Probekörpern mit der Spatially Modulated Illumination Microscopy |
|
|
Jürgen Bastert |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Development and Application of Quantification Methods for Microtubule Dynamics |
|
|
Adrian Pfeiffer |
|
|
Diplomarbeit
Diplomarbeit (4 MB)
|
| 2005 |
|
Totale Interne Refelxion Fluoreszenz Mikroskopiemit stehenden evaneszenten Wellen |
|
|
Ralf Gundling |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Simulation früh- und spätreplizierender Chromatin-Domänen. |
|
|
Daniel Hübschmann |
|
|
Diplomarbeit
Diplomarbeit als pdf (3.3 MB)
|
|
Zwei-Farbenhochpräzisionsdistanzmessungen mit dem SMI-Mikroskop. |
|
|
Susanne Fenz |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Vergleichende fluoreszenzoptische Untersuchungen zur Genom-,Mikro- und Nanoarchitektur der BCR- und ABL-Region an Kontroll-, Remissions und CML-Präparaten. |
|
|
Constance Großmann |
|
|
Diplomarbeit
|
|
High resolution 3D microscopic measurements with micro axialtomography |
|
|
Florian Staier |
|
|
Diplomarbeit
pdf (3.9 MB)
|
|
3D-mikroskopische Analyse von Zellkernen an der optischen Auflösungsgrenze nach spezifischer Vitalmarkierung mit PNA-Sonden. |
|
|
Helmut Schneider |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Totale Interne Refelxion Fluoreszenz Mikroskopiemit stehenden vaneszenten Wellen. |
|
|
Roman Amberger |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Brownsche Dynamik Simulationen von ganzen Zellkernen zur Bestimmung der Bewegungsmuster von Chromosomen und Genregionen auf der Grundlage des 1--Mbp SCD Modells |
|
|
Nick Kepper |
|
|
Dissertation
|
|
Einfluß stischer und dynamischer elektromagnetischer Felder auf die funktionelle Magnetresonanztomogrphie (fMRT) bei Patienten mit aktiver Tiefenhirn-Neurostimulation |
|
|
Georgi Jens Christoph |
|
|
Dissertation
|
|
Spatial Association of Homologous Pericentric Regions in Human Lymphocyte Nuclei during Repair. |
|
|
Shamci Monajembashi, Alexander Rapp, Eberhard Schmitt, Heike Dittmar, Karl-Otto Greulich, Michael Hausmann |
|
|
Biophysical Journal, Volume 88, 2309–2322
|
|
|
|
|
Biocomputing: Strahlenbiologische Risikovorhersage. |
|
|
G. Kreth, C. Cremer |
|
|
Ruperto Carola, Forschungsmagazin der Universität Heidelberg, 2/2005
|
|
|
|
|
In die Nanowelt der Zellen. |
|
|
Christoph Cremer, Thomas Holstein |
|
|
GIT Labor-Fachzeitschrift 6/2005, S. 512–513
|
|
|
|
|
hree-Dimensional Maps of All Chromosomes in Human Male Fibroblast Nuclei and Prometaphase Rosettes |
|
|
Andreas Bolzer, Gregor Kreth, Irina Solovei, Daniela Koehler, Kaan Saracoglu, Christine Fauth, Stefan Müller, Roland Eils, Christoph Cremer, Michael R. Speicher, Thomas Cremer |
|
High-precision SMI microscopy size measurements by simultaneous frequency domain reconstruction of the axial point spread unction. |
|
|
Christian Wagner,Udo Spöri, Christoph Cremer |
|
Nano-Sizing of Specific Gene Domains in Intact Human Cell Nuclei by Spatially Modulated Illumination Light Microscopy. |
|
|
Georg Hildenbrand, Alexander Rapp, Udo Spöri, Christian Wagner, Christoph Cremer,Michael Hausmann |
|
|
Biophysical Journal, Volume 88, 4312–4318
|
|
Zwei-Farbenhochpräzisionsdistanzmessungen mit dem SMI-Mikroskop |
|
|
Susanne Fenz |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Brownsche Dynamik Simulationen von ganzen Zellkernen zur Bestimmung der Bewegungsmuster von Chromosomen und Genregionen auf der Grundlage des 1--Mbp SCD Modells |
|
|
Nikolaus Kepper |
|
|
Dissertation
|
| 2004 |
|
Entwicklung und Konstruktion eines Mikroskopaufbaus zur Messung von Oberflächenrauhigkeiten an Biomaterial |
|
|
Werner Stadter |
|
|
Diplomarbeit
|
|
Quantifizierung der Perfusion mit Arterial Spin-Labeling Techniken in der Magnetresonanz-Tomographie an Hand eines Perfusionsphantoms |
|
|
Alexander Kroll |
|
|
Dissertation
|
|
Bildanalytische Erfassung der räumlichen Organisation von Chromatin in Lymphozyten, Fibroblasten und Tumorzellen |
|
|
Stefan Stein |
|
|
Diplomarbeit
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Chromosome territory arrangement and homologous pairing in nuclei of Arabidopsis thaliana are predominantly random except for NOR-bearing chromosomes |
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Ales Pecinka, Veit Schubert, Armin Meister, Gregor Kreth, Marco Klatte, Martin A. Lysak, Jörg Fuchs, Ingo Schubert |
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Chromosoma113: 258–269
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Nano-architecture of gene loci in intact cell nuclei detected by visible SMI-light microscopy |
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Georg Hildenbrand, Alexander Rapp, Udo Spoeri, Christian Wagner, Christoph Cremer, Michael Hausmann |
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submitted to PNAS
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Measuring the Size of Biological Nanostructures with Spatially Modulated Illumination Microscopy |
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Sonya Martin, Antonio Virgilio Failla, Udo Spoeri, Christoph Cremer, Ana Pombo |
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Molecular Biology of the Cell, Vol. 15, 2449–2455
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Generic Features of Tertiary Chromatin Structure as Detected in Natural Chromosomes |
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Waltraud G. Müller, Dietmar Rieder, Gregor Kreth, Christoph Cremer, |
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MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY, p. 9359–9370 Vol. 24, No. 21
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Superresolution size determination in fluorescence microscopy: A comparison between spatially modulated illumination and confocal laser scanning microscopy |
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Udo Spöri, Antonio Virgilio Failla, Christoph Cremer |
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Journal of Applied Physics 95, 8436-8443
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Superresolution size determination in fluorescence microscopy: A comparison between spatially modulated illumination and confocal laser scanning microscopy |
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Udo Spöri, Antonio Virgilio Failla, Christoph Cremer |
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Journal of Applied Physics 95, 8436-8443
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Three dimensional analysis of histone methylation patterns in normal and tumor cell nuclei, |
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M. Cremer, R. Zinner, S. Stein, H. Albiez, B. Wagler, C. Cremer, T. Cremer |
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European Journal of Histochemistry 2004; vol. 48, 11- 23
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Differences in centromere positioning of cycling and postmitotic human cell types |
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Irina Solovei, Lothar Schermelleh, Klaus Düring, Andrea Engelhardt, Stefan Stein, |
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Chromosoma 112: 410-423
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Virtual radiation biophysics: implications of nuclear structure |
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G. Kreth, J. Finsterle, C. Cremer |
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Cytogenet Genome Res 104:157 –161 (2004)
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Standardisation of FISH-procedures: Summary of the Second Discussion Workshop |
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Michael Hausmann, Christoph Cremer , Gustavo Linares-Cruz, Thomas C. Nebe, Katharina Peters, |
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Cellular Oncology, Vol 26, No 3, 119-224
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The Architecture of Chicken Chromosome Territories Changes during Differentiation |
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Sonja Stadler, Verena Schnapp, Robert Mayer, Stefan Stein, Christoph Cremer, Constanze Bonifer, |
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BMC Cell Biology 2004, 5:44
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Radial Arrangement of Chromosome Territories in Human Cell Nuclei: A Computer Model Approach Based on Gene Density Indicates a Probabilistic Global Positioning Code |
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G. Kreth, J. Finsterle, J. von Hase, M. Cremer, C. Cremer |
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Biophysical Journal, Volume 86 May 2004, 2803 –2812
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Rapid image acquisition in multi-photon excitation fluorescence microscopy |
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Andreas Schweitzer, Heinz Eipel, Christoph Cremer |
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Optik 115, No. 3 (2004) 115–120
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The nanosizing of fluorescent objects by 458 nm spatially modulated illumination microscopy using a simplified size evaluation algorithm |
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Andreas Schweitzer, Christian Wagner, Christoph Cremer |
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J. Phys.: Condens. Matter 16 (2004) S2393–S2404
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Neue Methoden zur Größen- und Formbestimmung von fluoreszierenden Nanostrukturen unter Verwendung der SMI-Mikroskopie |
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Christian Wagner |
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Dissertation
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Messungen am SMI-Mikroskop |
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Udo Spoeri |
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Dissertation
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| 2003 |
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Determination of Aortic Elasticity from MR and CT Images Using an Automatic Active Contour Model |
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Roland Krug |
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Dissertation
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Untersuchung der Nanoarchitektur von Genloci mittels SMI-Mikroskopie und spezifisch-kombinatorischer Fluoreszenzmarkierung |
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Lars Georg Hildenbrand |
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Dissertation
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Größen- und Distanzmessungen unter Verwendung von Ein- und Zweiphotonen-Anregung mittels rälich modulierter Beleuchtung |
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Andreas Schweitzer |
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Dissertation
pdf (5.2 MB)
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| 2002 |
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Quantitative Untersuchungen zur schnellen FISH Markierung von Chromosomen in fixierten Metaphasen |
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Lutz Schüssler |
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Dissertation
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Digitale Bildanalyse der radialen Verteilungen von spezifischen Subregionen im Zellkern |
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Johann-Philipp von Hase |
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Dissertation
pdf
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Aufbau und Anwendung mikroskopischer Systeme zur Messung an Einzelmolekülen |
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Irene Upmann |
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Dissertation
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Approaching the 3D organization of the human cell nucleus |
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Tobias Aurelius Knoch |
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Dissertation
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Advanced Method in Spatially Illumination (SMI) Microscopy |
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Antonio Virgilio Failla |
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Dissertation
pdf (1.2 MB)
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Four dimensional particle tracking in biological dynamic processes |
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Antonio Cavallo |
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Dissertation
pdf (2.1 MB)
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Untersuchung von Membran-DNA Komplexen in äußeren elektrischen Feldern |
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Holger Erfle |
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Dissertation
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Hochpräzisions-Fluoreszenzmessungen mit räumlich modulierter Anregung |
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Benno Albrecht |
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Dissertation
pdf (26.2 MB)
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| 2001 |
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Präzissionsdistanzmikroskopie zur DNA-Konformationsanalyse in Zellkernen |
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Andrea Weisel |
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Staatsexamensarbeit
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Simulation von Chromsomen und virtuelle Mikroskopie |
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Gregor Kreth |
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Dissertation
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Quantitative Bildananlyse von Zellkernen: radiale Position und Morphologie spezifischer Chromosomenterritorien |
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Vincenzo Enrico Calcagno |
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Diplomarbeit
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Untersuchung zur Optimierung von Distanzmessungen am Spatially Modulated Illumination Mikroskop |
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Christian Wagner |
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Diplomarbeit
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Brownsche Dynamik Simulation des Sperical 1-Mbp Chromatin Domain Modells von Zellkernen |
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Nikolaus Kepper |
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Diplomarbeit
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Distanzbestimmungen zwischen fluoreszenzmarkierten Oligonukleotiden mit Hilfe des Wellenfeldmikroskops |
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Alexander Kroll |
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Diplomarbeit
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| 2000 |
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3D Rekonstruktion von elektronenmikroskopischen Serienschnitten |
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Kurt Sätzler |
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Dissertation
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Untersuchung biomolekularer Wechselwirkungen mit Hilfe von Atomarer Kraftmikroskopie und optischen Pinzetten |
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I. Teßmer |
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Diplomarbeit
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Realisierung eines Prototyps einer temperaturstabilisierten Objektiv- und Interferometereinheit und erste Distanzmessungen am Heidelberger Wellenfeldmikroskop |
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T. Jäger |
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Diplomarbeit
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Quantitative Bildanalyse der DNA-Verteilung spezifischer Chromosomenterritorien im Zellkern |
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J. v. Hase |
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Diplomarbeit
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The Influence of Formamide on Thermal Denaturation Profiles of DNA and Metaphase Chromosomes in Suspension |
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I. Solovei, D. Kienle, G. Little, R. Eils, L. Savelyeva, M. Schwab, W. Jäger, C. Cremer, T. Cremer |
|
The Influence of Formamide on Thermal Denaturation Profiles of DNA and Metaphase Chromosomes in Suspension |
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J. Rauch, D. Wolf, M. Hausmann, C. Cremer |
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Handbook of Computer Vision and Applications |
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B. Jähne, H. Haußecker, P. Geißler |
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Academic Press, Vol 3
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Improvement of confocal Spectral Precision Distance Microscopy (SPDM) |
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P. Edelmann, C. Cremer |
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Nanolocalization measurements in spatially modulated illumination microscopy using two coherent illumination beams |
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B. Schneider, B. Albrecht, P. Jaeckle, D. Neofotistos, S Söding, Th. Jäger, C. Cremer |
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Optical Diagn. of Living Cells III
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Quantitative microscopy after fluorescence in situ hybridization - a comparison between repeat-depleted and non-depleted DNA probes |
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J. Rauch, D. Wolf, J.M. Craig, M. Hausmann, C. Cremer |
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J. Biochem. Biophys. Methods
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Towards a dynamical approach for the simulation of large scale, cancer correlated chromatin structures |
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G. Kreth, P. Edelmann, Ch. Münkel, J. Langowski, C. Cremer |
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Adv. in Microanatomy of Cells and Tissues ...
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Confocal laser-scanning 3D fluorescence microscopy, quantitative image analysis and computer modelling of X-chromosome territories |
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G. Kreth, P. Edelmann, Ch. Münkel, J. Langowski, C. Cremer |
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Proc. Europ. Vongress Electron Microscopy, Vol I
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Translocation frequentcies for X and Y chromosomes predicted by computer simulations of nuclear structure |
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G. Kreth, P. Edelmann, Ch. Münkel, J. Langowski, C. Cremer |
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Chromosome Structure and Function (invited Paper, in press)
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Reconstrucion of axial tomographic high resolution data from confocal fluorescence microscopy. |
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P. Edelmann, C. Cremer |
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Analytical Cellular Pathology
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3d-spectral precision distance microscopy (spdm) of chromatin nanostructures after triple-colour labeling: study of ... |
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A. Esa, P. Edelmann, L. Trakthenbrot, N. Amariglio, G. Rechavi, M. Hausmann, C. Cremer |
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Microscopy 199(2), pp.96-105
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|
Improvement of confocal spectral precision distance microscopy (SPDM). |
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P. Edelmann, C. Cremer |
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Optical Diagnostics of Living Cells III
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Chromosome territories, Interchromatin domain compartment and nuclear matrix: An integrated view of the functional nuclear architecture. |
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C. Cremer, G. Koester, H. Fink RHA, R. Heintzmann, M. Cremer, I. Solovei, D. Zink |
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Critical Reviews in Eukaryotic Gene Expression
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Analyzing the three-dimensional genome topology (Computer Vision and Application) |
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H. Bornfleth, P. Edelmann, C. Cremer |
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|
Computer Vision and Application
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F2 Applied Optics and Information Processing |
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P. Edelmann, B. Albrecht, V. Failla, A. Schweitzer, C. Cremer |
| 1993 |
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Identification and cytogenetic analysis of an abnormal pig chromosome for flow cytometry and sorting |
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|
Hausmann M, Popescu CP, Boscher J, Kerboeuf D, Dölle J, Cremer C |
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|
Naturforsch. 48c (1993) 645 – 653
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Time optimized analysis of slit scan chromosome profiles on a general purpose personal computer |
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Heilig R, Hausmann M, Rens W, Aten JA, Cremer C |
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CABIOS (Computer Applications in the Biosciences) 9: 381 – 385.
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| 1992 |
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Preparative continuous separation of biological particles by means of free-flow-magnetophoresis based on a free-flow-electrophoresis chamber. |
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Hartig R, Hausmann M, Schmitt J, Herrmann D, Riedmiller M, Cremer C |
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Electrophoresis 13: 674-676.
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„Nimmt in kurzer Folge Signale auf“. VMEbus Rechner in der Chromosomenanalyse |
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Dölle J, Hausmann M, Cremer C |
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VMEbus 6/4: 76 – 79.
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Development of a two parameter slit-scan flow cytometer for screening of normal and aberrant chromosomes: Application to a karyotype of Sus scrofa domestica (pig) |
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Hausmann M, Dölle J, Arnold A, Stepanow B, Wickert B, Boscher J, Popescu CP, Cremer C |
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Opt. Eng. 31: 1463 – 1469.
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| 1991 |
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Optical sectioning and 3d-image reconstruction to determine the volumes of specific chromosome regions in human interphase cell nuclei |
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Geiger B, Komitowski D, Jauch A, Hausmann M, Cremer T, Cremer C |
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Optik 86: 113 – 119
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| 1989 |
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Chromosome aberration detection with hybridized DNA probes: Digital image analysis and slit scan flow cytometry. |
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Cremer C, Hausmann M, Diaz E, Hetzel J, Aten JA, Cremer T |
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Automation of Cytogenetics (Hrg.: Lundsteen C, Piper J) Springer Verlag, Berlin, Heidelberg, New York: 123 – 132
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Classification of normal and aberrant chromosomes by an optical neural network in flow cytometry |
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Noethe S., Männer R, Hausmann M, Horner H, Cremer C |
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Optical Computing, Technical Digest Series 9: 14-17.
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