KIP-Veröffentlichungen

Jahr 2006
Autor(en) Adrian Pfeiffer
Titel Development and Application of Quantification Methods for Microtubule Dynamics
KIP-Nummer HD-KIP 06-28
KIP-Gruppe(n) F2
Dokumentart Diplomarbeit
Keywords (angezeigt) Microtubule SMI
Abstract (de) Ausgehend von der Kern-Positionierung in Spalthefe, einem durch Mikrotubuli bewirkten zellinternen Prozess, werden Methoden entwickelt, die neue Möglichkeiten zur Quantifizierung von Mikrotubuli und ihrer Dynamik bieten. Es wird herausgefunden, dass Kerne in Multikernzellen während Mitose in Richtung der Zellenden geschoben werden und sich anschließend zurück zur Mitte bewegen. Eine statistische Auswertung der Kerntrajektorien legt nahe, dass die Kernpositionierung großteils durch dieselben Kern-KortexWechselwirkungen mittels Mikrotubuli wie in einerWildtyp Zelle erfolgt, aber auch Kern-Kern Wechselwirkungen könnten Einfluss haben. Anhand von Random Walk Modellen wird untersucht, wie man aus Kern Trajektorien charakteristische Größen für den zugrunde liegenden stochastischen Prozess bestimmen kann. Analytische Herleitungen und Computer Simulationen ergeben, dass in bestimmten Fällen die zeitabhängige Kurtosis der Kern- Aufenthaltswahrscheinlichkeit eine Schätzmöglichkeit für die Bewegungsdauer eines speziellen Random Walk Modells bietet. Das SMI (Spatially Modulated Illumination) Mikroskop wird um Methoden erweitert, mit denen das Aufspüren der Enden einzelner Mikrotubuli, die in Bündeln organisiert sind, ermöglicht werden soll. Messungen an fixierten und lebenden Zellen können zwar keine einzelnen Mikrotubuli aufspüren, ergeben aber beachtenswerte Schätzungen für den Bündel Durchmesser.
Abstract (en) On the basis of nuclear positioning in fission yeast, an intra-cellular process mediated by microtubules, methods are developed that aim to provide new means for quantification of microtubule dynamics. It is found that the nuclei in multi-nuclear cells are pushed toward the cell tips during mitosis and recenter afterwards. Statistic analysis of nuclear trajectories suggests that nuclear positioning is governed to a large extend by microtubule mediated nuclei-cortex interactions like in wild-type cells, but influence might also come from mutual interactions between nuclei. In the context of random walk models it is investigated how nuclear trajectories can be used to determine characteristic quantities for the underlying stochastic process. As derived by computer simulations and analytically, the kurtosis of the spatial probability of finding and its time dependence can under certain circumstances be used to estimate the moving time of a special random walk model. The SMI (Spatially Modulated Illumination) microscope is extended by methods that aim to detect the start and end position of single microtubules that are organized in bundles. Measurements made on fixed cells and in vivo fail to detect single microtubules, but yield notable estimations for the diameter of microtubule bundles.
URL Diplomarbeit
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