KIP-Veröffentlichungen

Bei vielen Krebsarten wird eine Überexpression einzelner Proteinen diagnostiziert, welche zu unbegrenztem Wachstum und einer Unterdrückung des Zelltods führt. Die erhöhte Proteinexpression kann zwei Gründe haben: Entweder wird das entsprechende Gen aufgrund einer Fehlfunktion der die Transkription steuernden Proteine vermehrt abgelesen oder das Gen liegt mehrmals im Genom vor und die Kopien werden ebenfalls exprimiert.
Dementsprechend ist es von wissenschaftlichem Interesse, die Häufigkeit von Genen genau bestimmen zu können. Eine etablierte Methode ist die "Fluoreszenz in situ Hybridisierung"(FISH). Durch unterschiedliche Längen von Sonden und Genen kann es zu Ungenauigkeiten bei Amplikationsbestimmungen kommen. Ein Fortschritt in diesem Punkt wird bei dem Verfahren "Kombinierte Oligonukleotid (COMBO) - FISH"durch die Verwendung eines Satzes kurzer fluoreszierender Sonden, die über das zu untersuchende Gen verteilt sind, erzielt.
Im Laufe dieser Arbeit werden für häufig vorkommende Onkogene entsprechende Sondensets erstellt, die die Länge der etablierten FISH-Sonden um ein Vielfaches unterschreiten und durch die das Abzählen von Genen mit einer höheren Auflösung möglich ist. Außerdem ermöglicht die genaue Platzierung von COMBO-FISH Sonden eine präzise Untersuchung von Bruchstellen auf  Chromosomen und Translokationen, die zu Fusionsproteinen führen, welche als Auslöser der Leukämie gelten. Am Ende stehen Sondensets für eine schnelle und zuverlässige Diganose der angesprochenen Genommutationen zur Verfügung.

Many cancer cells show an overexpression of particular proteins, which leads to unlimited proliferation and suppression of apoptosis. The overexpression can arise from two reasons:
Either the transcription regulating protein malfunctions and the respective gene is excessively expressed or the gene exists repeatedly in the genome and the copies are also transcribed.
Therefore, an exact determination of the copy number of genes is of scientic importance. Fluorescence in situ hybridisation (FISH) is an established method. The dierence between the length of the genes and probes can result in inaccuracies. A progress in this aspect can be achieved by the approach "combinatorial oligonucleotide (COMBO) - FISH" by using a set of short
uorescent probes, which are spread over the complete gene of interest. Throughout this theses, such sets of probes for commonly amplied oncogenes are created. The shorter length of the set of probes enables the counting of copy number with a
higher resolution.
The precise placement of COMBO-FISH probes furthermore allows an accurate study of breakpoints on chromosomes and translocations, that result in fusion protein. Latter are considered to be the triggers of dierent kinds of leukaemia. Eventually, set of probes for a fast and reliable diagnosis of mentioned mutations of the genome are provided.