KIP-Veröffentlichungen

Jahr 2014
Autor(en) Michael Stuhlmüller
Titel Lokalisationsmikroskopie von Trinukleotidrepeat-Expansionen nach spezifischer COMBO-FISH-Markierung
KIP-Nummer HD-KIP 14-52
KIP-Gruppe(n) F18
Dokumentart Staatsexamensarbeit
Abstract (de)

Beim fragilen X-Syndrom (FXS) handelt es sich um die häugste vererbba-
re Ursache von geistiger Retardierung. Die Ursache für diese Retardierung ist
die Verlängerung eines repetitiven Bereiches vor dem FMR1-Gen über den
Schwellwert von 200 (CGG)-Repeats. In dieser Arbeit wurde diese Expansi-
onsregion in verschiedenen Zelllinien spezisch mit kombinatorischer Oligonu-
kleotid-Fluoreszenz-In-Situ-Hybridisierung (engl. Combinatorial-Oligonucleo-
tide-Fluorescence-In-Situ-Hybridisation, COMBO-FISH) markiert. Anschlie-
ÿend wurden die markierten Zellkerne mit Epiuoreszenz-, Konfokal- und Lo-
kalisationsmikrokopie untersucht. Dabei konnte durch die Kolokalistion von
FMR1-Promotor-Sonden und den Expansions-Sonden deren Spezität auf dem
Genom nachgewiesen werden. Zusätzlich wurden die zur Auswertung der Lo-
kalisationsaufnahmen verwendeten Programme und Skripte überarbeitet und
an die Anforderungen angepasst. Abschlieÿend wurden die Cluster, die von
den gebundenen COMBO-FISH-Sonden gebildet werden, hinsichtlich Gröÿe,
Anzahl der Sonden und Distanzen untersucht.

Abstract (en)

The fragile X syndrome is the main cause of inherited mental retardation. It is
caused by an amplication of the repetetive region upstream of the FMR1 gene
above a level of 200 (CGG)-repeats. Within this work these expansion region
of dierent celllines was specically labeled by the use of Combinatorial-Oli-
gonucleotide-Fluorescence-In-Situ-Hybridisation (COMBO-FISH). After that
the marked nuclei were examined by the use of epiuorescence, confocal and
localisation microscopy. So it was possible to prove the specicity of the ex-
pansion aimed probes by their colocalisation with the FMR1-promotor-probes.
Furthermore the programs and skripts used for analysing the localiation data
were reviewed and edited to t the requirements. Finally studies of the clus-
ters formed by the bound COMBO-FISH-probes were done regarding their
size, number of signals and distances.

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